Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NPIPB9F8W1W9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NPIPB9F8W1W9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms