Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
E9PBE3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PBE3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PBE3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PBE3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PBE3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PBE3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PBE3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PBE3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PBE3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PBE3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PBE3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
E9PBE3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9PBE3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9PBE3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9PBE3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9PBE3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
E9PBE3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9PBE3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9PBE3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9PBE3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
E9PBE3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
E9PBE3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
E9PBE3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PBE3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PBE3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PBE3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PBE3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PBE3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PBE3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
E9PBE3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PBE3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PBE3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PBE3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PBE3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PBE3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PBE3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PBE3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PBE3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PBE3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PBE3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PBE3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PBE3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
E9PBE3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9PBE3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PBE3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PBE3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PBE3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PBE3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PBE3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9PBE3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PBE3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PBE3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PBE3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PBE3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PBE3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PBE3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PBE3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PBE3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PBE3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PBE3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PBE3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9PBE3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms