Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DIRC3C9JPN6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DIRC3C9JPN6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms