Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C4orf47A7E2U8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C4orf47A7E2U8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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