Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP27XA6NNY8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP27XA6NNY8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms