Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RGPD3A6NKT7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD3A6NKT7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms