Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN0

OTOL1, Otolin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOL1A6NHN0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTOL1A6NHN0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
OTOL1A6NHN0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms