Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CFAP73A6NFT4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CFAP73A6NFT4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CFAP73A6NFT4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms