Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL33A6NCF5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KLHL33A6NCF5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms