Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTPDC1A2A3K4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTPDC1A2A3K4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PTPDC1A2A3K4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms