Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
A0A0U1RQF3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A0U1RQF3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms