Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TTC8-205ENST00000358622 2297 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PCDHB15-201ENST00000231173 4017 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ZNF202-201ENST00000336139 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LINC00365-201ENST00000413591 2618 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CDHR4-202ENST00000412678 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ZSCAN21-201ENST00000292450 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LINC00667-205ENST00000582008 3979 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 JPT2-206ENST00000562684 3185 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PCDHB6-201ENST00000231136 3266 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PTPN7-202ENST00000367279 3265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ERVMER34-1-201ENST00000440542 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 APOBEC3B-203ENST00000402182 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 GABBR1-201ENST00000355973 3506 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ZBTB20-212ENST00000474710 2757 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TBC1D3I-203ENST00000621034 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 IL2RG-204ENST00000456850 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC020928.1-201ENST00000590750 1850 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 TRIM32-203ENST00000450136 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SLC22A14-202ENST00000448498 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 PAAF1-215ENST00000544909 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 FGFR1-208ENST00000397108 2870 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 GNG11-201ENST00000248564 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ENO1-201ENST00000234590 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 ARSG-209ENST00000621439 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 MTMR2-202ENST00000352297 3350 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
LSAMPQ13449 RAB7B-202ENST00000617991 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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