Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 KLC4-203ENST00000394056 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 UBE2W-201ENST00000419880 2315 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PTPRJQ12913 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms