Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 CDK16-201ENST00000276052 3016 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 IFT43-202ENST00000314067 833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 SEC14L2-201ENST00000402592 1229 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 TMEM176A-201ENST00000004103 1261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 VPS33A-202ENST00000451053 1154 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 RN7SL225P-201ENST00000464648 298 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 FGL1-206ENST00000518650 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AL049871.1-201ENST00000557475 880 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AC134312.5-202ENST00000562705 756 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 KRTAP10-9-203ENST00000616529 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 PABPC1L-207ENST00000372824 2223 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AC107375.1-201ENST00000564464 2231 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AKIRIN1P2-201ENST00000440655 570 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 SNHG14-207ENST00000452731 1064 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 RPLP0P2-204ENST00000490750 961 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AL354993.2-201ENST00000558738 542 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 PSMD7-205ENST00000568615 931 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AC073254.1-209ENST00000604677 631 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 NUP85-201ENST00000245544 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 GNLY-201ENST00000263863 846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 CXorf40B-201ENST00000355203 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 S100B-202ENST00000367071 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 ART2P-201ENST00000415521 822 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 UCMA-202ENST00000463405 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 RN7SL43P-201ENST00000463926 291 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 OR5BA1P-201ENST00000529722 982 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AC087441.1-201ENST00000531069 301 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 CHORDC2P-201ENST00000557601 1090 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 DDX39B-201ENST00000376177 1529 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 CCDC32-214ENST00000561011 1577 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AL132656.1-201ENST00000452173 490 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 RN7SL521P-201ENST00000488398 297 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AC127496.3-201ENST00000576032 494 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AD000091.1-201ENST00000592379 287 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AC147067.2-201ENST00000608161 289 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 AP000925.1-201ENST00000425960 1449 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 GUCY1B3-207ENST00000513437 2355 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
XIRP2A4UGR9 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ZNF669-204ENST00000448299 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TIMP1-201ENST00000218388 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TIMP1-202ENST00000377017 626 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P46-201ENST00000411735 937 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC021678.2-201ENST00000521731 887 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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