Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 GYG2-204ENST00000381163 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MRRF-201ENST00000297908 1841 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CUL4BQ13620 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CUL4BQ13620 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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