Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TRGV4-201ENST00000390345 688 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 GSTM2P1-201ENST00000405166 654 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MAP1LC3BP1-202ENST00000438342 516 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC104623.1-201ENST00000446357 546 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC138035.2-201ENST00000509192 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC022424.2-201ENST00000514848 454 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC012615.6-203ENST00000590531 272 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 LINC02193-207ENST00000621799 723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC069287.1-202ENST00000622626 723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 WASH5P-206ENST00000632506 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ZNF101-203ENST00000415784 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SH3GLB2-206ENST00000417224 1468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLD1P28340 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SERPIND1-202ENST00000406799 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 C3orf36-201ENST00000408895 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ANAPC15-201ENST00000227618 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 FTH1P19-201ENST00000402402 528 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PFN1P10-201ENST00000455962 327 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 RPSAP5-201ENST00000485258 884 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 HNRNPA1P55-201ENST00000505935 955 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ELP5-210ENST00000573657 687 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC011456.1-201ENST00000592270 536 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 MIR7704-201ENST00000610524 59 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 AC245369.3-201ENST00000624687 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 LMX1A-203ENST00000367893 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
POLD1P28340 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms