Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 HTR4-201ENST00000360693 3082 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CTCFL-211ENST00000502686 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 OBP2A-202ENST00000342114 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 GGT8P-201ENST00000418938 532 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 VEGFA-210ENST00000457104 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 VTI1BP1-201ENST00000486325 700 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 VEGFA-218ENST00000518689 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 VEGFA-223ENST00000523125 541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MIF4GD-214ENST00000618645 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SLC26A5-201ENST00000306312 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 OAS1-201ENST00000202917 1816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC069181.1-201ENST00000498256 554 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 PDZRN3-AS1-202ENST00000608304 774 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SFTPA1-203ENST00000428376 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TAF1P21675 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 MYH9-202ENST00000401701 789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AC006273.1-201ENST00000606966 861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TNNI2-206ENST00000617947 699 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SEC22C-205ENST00000417572 1513 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1P21675 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms