Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MARCH8-204ENST00000453424 5638 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TBC1D16-202ENST00000340848 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ZNF555-203ENST00000591539 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ZCRB1-201ENST00000266529 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ANGEL2-208ENST00000535388 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NBPF17P-201ENST00000401087 2119 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PLEKHG4-202ENST00000379344 4513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LHX6-204ENST00000394319 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AGAP3-226ENST00000622464 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 IL12A-AS1-203ENST00000497452 2425 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LINC01471-201ENST00000461398 3079 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 BORA-202ENST00000377815 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 RAB3IP-201ENST00000247833 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 BRD1-202ENST00000404034 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ABAT-201ENST00000268251 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ACADL-201ENST00000233710 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SLC2A1-203ENST00000426263 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 C17orf51-201ENST00000391411 7914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TRMT1-202ENST00000357720 2142 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 UBASH3B-201ENST00000284273 6912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ARL13B-201ENST00000303097 3264 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 MYO19-203ENST00000610930 3271 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 EPB42-202ENST00000441366 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 AP002986.1-201ENST00000602376 1763 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SCRN1-207ENST00000434476 1454 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CMTR2-202ENST00000434935 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 LINC01987-201ENST00000593118 2281 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 DNM3-206ENST00000520906 4454 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ANKRD20A7P-201ENST00000402318 2414 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 PNPLA7-201ENST00000277531 4581 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 GZF1-201ENST00000338121 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 TRMT10B-203ENST00000377754 1881 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
SMIM3Q9BZL3 CACNB3-204ENST00000547230 2395 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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