Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AL035422.2-201ENST00000603059 565 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 LINC01134-203ENST00000442673 3059 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GPR82-201ENST00000302548 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 RCAN1-202ENST00000381132 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 NHSL2-202ENST00000510661 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 APOL3-205ENST00000397293 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SPOCK3Q9BQ16 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms