Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC116552.1-201ENST00000563243 733 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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TCOF1Q13428 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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TCOF1Q13428 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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TCOF1Q13428 ZNF726-204ENST00000531821 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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TCOF1Q13428 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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TCOF1Q13428 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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TCOF1Q13428 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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TCOF1Q13428 PPARA-202ENST00000402126 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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TCOF1Q13428 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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TCOF1Q13428 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 AL139220.2-222ENST00000627999 756 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 APTX-201ENST00000309615 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 PSAT1-201ENST00000347159 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 RORC-201ENST00000318247 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TCOF1Q13428 FHL2-208ENST00000409807 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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