Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LGALS8-208ENST00000416919 6097 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 SP140L-203ENST00000415673 2665 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 IYD-208ENST00000500320 2158 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 TRIM21-201ENST00000254436 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC245100.6-201ENST00000427169 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 SPOCK3-203ENST00000421836 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LINC00908-202ENST00000578613 2242 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRP55822 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TNS2-210ENST00000549700 4525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 KCTD21-AS1-207ENST00000600795 1549 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ARHGEF10-205ENST00000518288 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MESD-201ENST00000261758 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
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