Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 UTP3-201ENST00000254803 2073 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ZNF749-201ENST00000334181 2587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LAMB1-203ENST00000393560 2806 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CENPP-201ENST00000375576 3088 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 DDX3P1-201ENST00000418231 1950 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 C16orf82-202ENST00000505035 2459 ntAPPRIS P5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 JAK3-204ENST00000527670 3996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 KLK2-203ENST00000391810 2674 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TBC1D3B-202ENST00000611257 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 WFS1-202ENST00000503569 3255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LINC02140-202ENST00000566649 2017 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 MX1-201ENST00000288383 2733 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 NLRC3-201ENST00000324659 3414 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 C14orf159-234ENST00000525393 2471 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RHOH-221ENST00000615577 2227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RHOH-223ENST00000619474 2230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SRP19-206ENST00000515463 660 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ANKRD30BP2-202ENST00000447861 3260 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 FO681491.1-201ENST00000623586 3260 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 DENND2A-210ENST00000537639 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ADGRE2-206ENST00000594294 2325 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 ZWINT-203ENST00000373944 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SMARCA1-201ENST00000371121 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 CNTROB-201ENST00000380262 3769 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 PRRX1-207ENST00000497230 3501 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 TSC22D3-206ENST00000372397 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LSAMPQ13449 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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