Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC093826.1-201ENST00000508655 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PTGS1P23219 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms