Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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HOXA3O43365 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
HOXA3O43365 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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