Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLIP2Q9UDT6 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms