Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PYM1-203ENST00000408946 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USP35Q9P2H5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms