Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

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Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CTC1Q2NKJ3 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CTC1Q2NKJ3 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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