Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 MTHFSD-201ENST00000360900 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 SEPT2-204ENST00000391973 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 PRIMA1-202ENST00000393140 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 SPICE1-201ENST00000295872 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 FAM95C-205ENST00000637556 2421 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ZBTB26-201ENST00000373654 2047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 BCDIN3D-AS1-201ENST00000548872 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 CALM1-201ENST00000356978 4242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ZNF740-201ENST00000416904 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC098650.1-201ENST00000635992 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 CHD4-211ENST00000544484 6554 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 NUAK2-201ENST00000367157 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ZNF461-201ENST00000360357 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ELMO1-201ENST00000310758 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ST3GAL6-202ENST00000394162 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 AC080013.1-204ENST00000607426 2185 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 RBM39-203ENST00000361162 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NBR1Q14596 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms