Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 Z82195.2-202ENST00000458525 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GPC3P51654 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GPC3P51654 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GPC3P51654 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms