Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AC022201.1-201ENST00000452525 577 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 AC016735.1-201ENST00000457457 237 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 AC092471.2-201ENST00000637219 651 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GLI3P10071 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 FAM156A-223ENST00000623782 1931 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 Z98259.1-201ENST00000564261 1697 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 CACNG1-201ENST00000226021 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 RARRES3-202ENST00000354445 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 PRKCE-202ENST00000394874 996 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 AL357054.1-201ENST00000407035 1227 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 C3orf18-202ENST00000422619 551 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 MIR646HG-204ENST00000427820 805 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 AL390726.1-201ENST00000451357 202 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 SNHG14-207ENST00000452731 1064 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 PRAMEF35P-201ENST00000458709 891 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 IGKV1-8-201ENST00000495489 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 AL162464.2-201ENST00000557761 526 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 ABCC6P1-202ENST00000565118 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 AC090236.1-201ENST00000590318 768 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 NOP16-210ENST00000619979 963 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 TNFSF13-209ENST00000625791 955 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 CGREF1-209ENST00000640154 336 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 M1AP-201ENST00000290536 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GLI3P10071 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GLI3P10071 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GLI3P10071 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PRL-203ENST00000617911 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 KLK8-201ENST00000291726 853 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 GNRH2-203ENST00000380346 353 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 RPSAP46-201ENST00000428316 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 RPLP0P2-204ENST00000490750 961 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC069234.1-201ENST00000542620 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC006236.1-201ENST00000576249 797 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 IST1-221ENST00000544564 1500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 SYT17-204ENST00000562711 1702 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GLI3P10071 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GLI3P10071 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms