Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 LINC01922-201ENST00000562582 719 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SH3BP2P78314 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms