Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SLC2A14-205ENST00000535295 1732 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TESPA1-202ENST00000449076 2010 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SLC7A9-201ENST00000023064 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 UBTF-209ENST00000529383 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TNFSF9P41273 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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