Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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