Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 Z97653.2-201ENST00000623057 1418 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC135506.1-201ENST00000603877 1799 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ACKR1-202ENST00000368122 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ANAPC15-203ENST00000502597 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 PRR3-201ENST00000376557 1797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 GOSR2-209ENST00000575949 1444 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CSRNP3Q8WYN3 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms