Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 LINC00563-201ENST00000566370 1400 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CHIAP2-201ENST00000369743 2829 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 BAIAP3-204ENST00000426824 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 DUSP11-202ENST00000443070 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 KCNJ10-201ENST00000368089 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC112Q8NEF3 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 PRKAB1-206ENST00000541640 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 BSDC1-201ENST00000341071 4599 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC112Q8NEF3 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms