Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 RN7SKP255-201ENST00000363442 313 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 RN7SKP203-201ENST00000363618 332 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 RN7SKP71-201ENST00000364558 318 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 7SK.1-201ENST00000365328 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FAM25E-201ENST00000411791 322 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AL359979.2-201ENST00000435108 613 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC005011.1-201ENST00000455206 210 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 RAB42P1-201ENST00000555078 316 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FXYD3-210ENST00000604621 548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 IGHD-202ENST00000613640 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AL356583.3-201ENST00000412354 417 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CNTNAP1P78357 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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CNTNAP1P78357 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC022447.2-201ENST00000509750 543 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 TMEM241-208ENST00000542162 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 Metazoa_SRP.152-201ENST00000614413 286 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC112702.1-201ENST00000623712 366 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 MGST3-214ENST00000627653 1130 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CNTNAP1P78357 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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