Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PCNAP12004 ABR-202ENST00000302538 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNAP12004 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNAP12004 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNAP12004 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNAP12004 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PCNAP12004 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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PCNAP12004 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PCNAP12004 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PCNAP12004 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PCNAP12004 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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