Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 IL19-201ENST00000270218 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 CLASP2-218ENST00000487200 1940 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SCN2BO60939 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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SCN2BO60939 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SCN2BO60939 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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