Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AIF1L-201ENST00000247291 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MCM5-202ENST00000382011 2402 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PJA1-204ENST00000374584 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ZYX-203ENST00000392910 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SLC7A3-202ENST00000374299 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TMEM8B-201ENST00000377988 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 LRRC8E-201ENST00000306708 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RNF10-201ENST00000325954 3825 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CAV1-209ENST00000614113 3201 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 LEPR-201ENST00000344610 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ABCC4-207ENST00000629385 2903 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CPT1B-204ENST00000405237 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 RSBN1-206ENST00000616024 2703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SF1-204ENST00000377390 3470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 CXCL13-201ENST00000286758 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CTRB1P17538 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms