Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 OR2V2-202ENST00000641492 4777 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SUCO-209ENST00000610051 2925 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 PHF21B-203ENST00000403565 3586 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 VASH2-203ENST00000366965 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AL132642.2-201ENST00000623423 1998 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 PRKCG-201ENST00000263431 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 HDLBP-204ENST00000391976 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 SP7-201ENST00000303846 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ERVK-18Q9QC07 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 EIF2AK1-201ENST00000199389 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 IGSF11-202ENST00000393775 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
ERVK-18Q9QC07 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms