Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 FARS2-201ENST00000274680 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ZNF595-203ENST00000608255 1999 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CYP24A1-203ENST00000395955 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MCMBPQ9BTE3 HNRNPUL1-207ENST00000595018 2794 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms