Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 VSTM2A-201ENST00000302287 3401 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 MLX-203ENST00000435881 2428 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 LINC01024-201ENST00000499203 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 KIR3DL1-203ENST00000391728 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ADIRF-AS1-203ENST00000609111 3822 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CAPZA3Q96KX2 CHD1L-202ENST00000369258 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 RIMS1-201ENST00000264839 7055 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 EPM2A-207ENST00000611340 2786 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 AC096564.1-201ENST00000499098 2810 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 FAM184A-211ENST00000521531 3244 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 PASK-203ENST00000403638 5161 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 KCNAB2-202ENST00000341524 4207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CAPZA3Q96KX2 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms