Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CPA5-203ENST00000461828 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ATL2-201ENST00000378954 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 CA6-205ENST00000480186 1493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ANKDD1A-207ENST00000496660 1477 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 TRPC7-202ENST00000378459 2406 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 SERPING1-203ENST00000378323 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LMO3Q8TAP4 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LMO3Q8TAP4 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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