Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC026583.1-201ENST00000561310 569 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC090616.6-202ENST00000583601 1088 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AC006547.1-206ENST00000600617 878 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD1P28340 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLD1P28340 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SRSF9P1-201ENST00000399149 530 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AL162595.1-201ENST00000429227 868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC004112.1-201ENST00000431064 561 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC116347.1-201ENST00000442824 720 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PGAP2-219ENST00000479072 894 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC009238.3-201ENST00000512705 217 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 HDAC2-AS2-216ENST00000522844 808 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ELOBP2-201ENST00000526184 355 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 GABARAPL1-203ENST00000535576 792 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 NAA60-236ENST00000577013 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MIR1587-201ENST00000583319 53 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AL590491.2-202ENST00000611126 418 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD1P28340 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 GGPS1-203ENST00000391855 1407 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 OR10K2-201ENST00000314902 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 UGT1A6-202ENST00000373424 1128 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD1P28340 AC067942.2-201ENST00000506227 1268 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms