Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

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Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATP2B1P20020 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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