Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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EPB42P16452 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
EPB42P16452 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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EPB42P16452 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EPB42P16452 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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EPB42P16452 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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EPB42P16452 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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EPB42P16452 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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EPB42P16452 MYO7A-205ENST00000458637 7336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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EPB42P16452 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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EPB42P16452 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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EPB42P16452 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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EPB42P16452 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EPB42P16452 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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