Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 PDE4C-213ENST00000598111 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GLI3P10071 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GLI3P10071 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GLI3P10071 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 CACNA1G-AS1-202ENST00000505793 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 PFN1P3-201ENST00000443612 402 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 PFN1P4-201ENST00000450970 402 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 PRKRIP1-202ENST00000462601 884 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 UCMA-202ENST00000463405 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AC020893.2-201ENST00000506083 723 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AC090095.1-201ENST00000519275 871 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AC138305.1-201ENST00000568932 561 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AC010601.1-201ENST00000569048 446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 SNHG5-211ENST00000587692 1029 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 SRGAP3-AS2-203ENST00000600323 1294 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AL355353.1-201ENST00000604014 330 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AC105105.4-201ENST00000610389 713 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 BX005132.1-201ENST00000641403 1580 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GLI3P10071 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 CNMD-201ENST00000377962 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AL662907.1-201ENST00000622988 1360 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 TRBV22-1-201ENST00000424543 337 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 CYP4F60P-201ENST00000439449 549 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 ORMDL2-204ENST00000550836 438 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 PIMREG-209ENST00000576056 833 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 PPATP1-201ENST00000496669 1547 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AC106799.1-201ENST00000503188 1676 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
GLI3P10071 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI3P10071 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI3P10071 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI3P10071 LILRB4-205ENST00000430952 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI3P10071 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI3P10071 MEF2C-207ENST00000503554 1345 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI3P10071 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI3P10071 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI3P10071 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI3P10071 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GLI3P10071 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms