Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RNASEH2CP1-201ENST00000454281 502 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC025576.1-201ENST00000536455 462 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 NRSN2-206ENST00000608736 712 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AL031590.1-202ENST00000641466 1737 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC097474.1-201ENST00000506481 1371 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RN7SL638P-201ENST00000494527 290 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 EEF1AKMT3-203ENST00000548256 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRAMEF18Q5VWM3 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms