Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
AP3M2P53677 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms