Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 AL356414.1-201ENST00000379526 686 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 SMIM21-201ENST00000382638 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 TCP10-205ENST00000476779 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AC080023.2-201ENST00000532615 208 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AC126471.1-201ENST00000550676 362 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AL391152.1-202ENST00000551408 624 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 BID-211ENST00000611040 419 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 FURIN-208ENST00000640725 224 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AC006262.1-201ENST00000593980 1316 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 ULBP3-201ENST00000367339 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 RPL36P20-201ENST00000423702 319 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AC006001.3-205ENST00000428370 579 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AL929472.4-201ENST00000447422 691 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 LILRB1-AS1-201ENST00000456337 554 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 RN7SL255P-201ENST00000470639 296 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 RAET1G-203ENST00000479265 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AC092471.1-201ENST00000536497 572 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AC116553.1-201ENST00000561752 397 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 CNTNAP2-207ENST00000628930 1944 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 MEMO1-207ENST00000426310 1336 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 RPSAP19-201ENST00000431241 880 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 MTND6P14-201ENST00000433044 522 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 CLDN16-202ENST00000456423 430 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AC069234.1-201ENST00000542620 583 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AC104041.1-202ENST00000560097 566 ntTSL 4 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 TNFSF13-209ENST00000625791 955 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 VRK3-205ENST00000593919 1979 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 SYNGR4-201ENST00000344846 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 LAIR1-217ENST00000474878 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 MESTP2-201ENST00000559787 889 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AP001120.3-201ENST00000585729 489 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 SIGLEC17P-201ENST00000593736 484 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 C12orf45-201ENST00000280749 459 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 GNRH2-203ENST00000380346 353 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 IGLV1-44-201ENST00000390297 467 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 LINC01128-201ENST00000415295 894 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 TRGV2-201ENST00000426402 544 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AC010240.1-201ENST00000429606 459 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AL390726.1-201ENST00000451357 202 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AC068620.1-201ENST00000470544 798 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 TMEM161B-AS1-204ENST00000504636 1039 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AC140658.2-201ENST00000566360 348 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AC092368.1-201ENST00000568014 733 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AP003419.3-201ENST00000613900 527 ntTSL 3 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 MFSD12-215ENST00000615613 688 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PKHD1P08F94 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms